歐盟啟動“類器官單細胞圖譜”項目
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HCA|Organoid是新啟動的歐盟研究項目,該項目結合了單細胞特征分析和類器官技術,用以驗證類器官是人類生物學的可靠模型。該項目旨在開發一個開放存取的“類器官單細胞圖譜”。它是歐盟地平線2020框架計劃資助的六個試點行動之一,將幫助歐洲完成對“人體細胞圖譜”工程的奠基(www.humancellatlas.org/euh2020)。
類器官是在體外生成的微型化和簡化的3D器官。
類器官用于在實驗室環境中研究疾病和治療方法。
HCA|Organoid將建立在線公開圖譜, 匯總并分享單細胞類器官數據。
類器官可以作為人類生理學和病理學的模型,可實現在人類身上難以或無法進行的干預研究。同時這也減少了對動物實驗的需求。類器官也可用于藥物開發和個性化醫療,例如癌癥治療或遺傳性疾病,如囊性纖維化。最后,類器官還有助于推動再生醫學的發展,其最終目標是產生可移植到患者體內的功能性生物結構。
單細胞技術為理解生物學提供了一個全新的視角,具有推動治療進展的深遠潛力,并使歐洲處于個性化醫學和再生生物學的前沿。為了簡化研究并加速這一領域的科學進步,人類細胞圖譜(HCA)項目倡議為建立人體所有細胞類型綜合參考圖譜這一目標提供了全球性的協調。
在HCA的全球背景下,新的歐洲研究項目HCA|Organoid已經著手建立“類器官單細胞圖譜”。這一舉措將在HCA內建立人體類器官的單細胞分析,從而推動生物醫學研究。這一愿景在一份戰略文件中進行了概述,該文件已作為預印本公開發表 (DOI: 10.5281/zenodo.4001718)。簡而言之,研究人員將把單細胞數據作為 "羅塞塔石",幫助從患者的組織樣本中獲得的結果和對體外生長的實驗性更強的類器官(構成實驗室中的 "患者化身")之間進行轉化。例如,研究人員可以在原發性患者樣本中確定一種新的疾病相關細胞類型,在人體類器官中創建等效細胞,然后在體外研究潛在的治療策略。
為實現這一愿景,HCA|Organoid項目最初將專注于建立單細胞轉錄組、表觀基因組,以及人體類器官和來自健康捐贈者的匹配初級組織的時間序列成像。該項目將從100個個體中提取并全面描述人類大腦和結腸類器官的特征,以捕捉種群變異,為以疾病為中心的研究建立全面的參考。單細胞圖譜將被整合到一個公開的類器官細胞圖譜中,該門戶將為用戶提供與人類原始樣本相關的類器官單細胞數據。這一科學資源將支持多項概念驗證研究,例如關注腦器官中遺傳性癲癇的疾病模型、結腸癌模型以及結腸器官中與疾病相關的遺傳變異的表征。
HCA|Organoid項目匯集了8個合作機構的聯合體,包括來自奧地利、德國、荷蘭和瑞士的類器官、單細胞圖譜、高級成像和生物信息學方面的專家。除了最初專注于大腦和結腸類器官的單細胞剖析外,該項目還將啟動一個開放的、合作的研究人員和倡議網絡,旨在對其他不同的人體類器官進行單細胞表征。






